Про прописку ребенка для списания части долга по молодой семье ни где не сказано. Это имеет значение только в момент постановки на очередь, включения в программу или получения квартиры по молодой семье. А когда квартира уже получена - прописка не имеет значения. В новую квартиру вас не пропишут, пока не выплатите долг за нее, а старая квартира уже никого не интересует.
Так что, если у участника Программы МСДЖ, уже получившего квартиру, родился ребенок, то должны списать часть долга вне зависимости от его прописки.
В программе же сказано, что списание производится по факту рождения и других оснований не надо.